Mint minden korábbi verzió, Pokemon Crystal verzió hamarosan megvásárolható a Nintendo 3DS eShop-on.
A Nintendo bejelentette Crystal verzió 2017. január 26-án lesz a 3DS-re, és 9,99 dollárba kerül. További funkciók is hozzáadódnak a játékhoz.
Kifejezetten, Kristály kompatibilis lesz a Pokemon Bankkal, lehetővé téve a játékosok számára, hogy átvegyék azt, amit befognak az újabb címekbe, mint pl Ultra Sun és Ultra Moon. Lehetővé teszi továbbá a keresztes csatát és a régebbi verziókkal való kereskedést is Piros, Kék, és Sárga, a Time Capsule nevű szolgáltatáson keresztül.
A játék befejezése után a játékosoknak lehetőségük nyílik Celebit rögzíteni egy játékon belüli eseményen. Ez ellentétben áll az eredetivel Pokemon Crystal, amihez szükség volt egy speciális tartozékra, a Game Shark-ra, hogy megpróbálja megcsinálni ezt a ritka Pokemon-t.
A Nintendo azt is megállapítja, hogy a Pokemon Crystal, most már lehetséges lesz a Pokemon a sorozat összes 29 magjátékáról a továbbítására Ultra Sun és Ultra Moon.